かなりの難問だと思います。答えは自信がないですが、
初療時：喀痰塗抹でStreptococcus pneumoniaeが陽性＝起炎菌
４日目：喀痰培養でStaphylococcus aureusが陽性かつ全身状態安定＝起炎菌ではなく常在菌？（入院歴も多数ありMRSAの常在化を招く機会は多数？）
と考え、cをえらびました